В зависимости от типа пользователя HelpDesk системы установлены определенные ограничения к функциональным возможностям платформы. Далее разделение происходит по группам, по отделам организации. Расширенные возможности работы доступны менеджерам клиентских компаний или партнёров.

Возможные действия, отображение и доступы к модулям и функциям HelpDeskEddy могут быть отрегулированы для каждого пользователя.